《Shuffle! Memories》的故事从神族少女希娅在河边捡到一个昏迷的少年土见禀开始，禀醒来时什么都不记得，只知道自己叫土见禀，希娅把他带回家，希娅的父亲是神界国王，他看到禀的第一眼就说这个人类身上有神族和魔族同时留下的印记。没过多久魔界公主奈莉奈也找上门来，她说禀是她失散多年的婚约者，魔王菲亚也是禀的旧识，她开着魔法飞艇来接禀回魔界，两大势力为了禀的归属差点在人间开战。禀被夹在神族、魔族和人类三界之间，完全不知道该怎么办，希娅温柔体贴，总是笑着说只要禀开心就好，奈莉奈傲娇又黏人，嘴上说禀是她的所有物，可每次禀受伤她比谁都紧张，菲亚成熟稳重，她送给禀的定情信物是一枚能打开魔界之门的水晶吊坠。禀在人间还有几个青梅竹马，枫是个假小子，从小跟禀一起爬树打架，亚沙是班长，温柔懂事，暗恋禀多年却不敢说，还有铃，一个神出鬼没的魔法少女，每次出现都在禀被神魔两界争吵搞得头大的时候，用恶作剧让他暂时忘记烦恼。禀发现自己是神魔两界为了维持平衡而共同创造的人柱，他的存在本身就是为了承载三界之间流动的魔法能量，如果他选择任何一方，三界就会失衡。在2026年AI大模型和DeepSeek低成本推理被用于跨语言交流、算力全国一体化统筹监测覆盖虚拟世界的背景下，禀用AI工具学习神族和魔族语言，用芯片技术做的翻译器跟希娅的父亲谈判，用低空经济无人机在神魔两界之间送信，用MR眼镜让三界代表在虚拟空间里开会，用机器人产业做的魔法傀儡代替自己应付两边逼婚，用碳中和理念设计了一座三界共享的魔法花园，还通过服贸会平台把神魔文化做成沉浸式体验展。希娅和奈莉奈从情敌变成了联手搞事业的搭档，她们发现禀的记忆是被神魔两界长老联手封印的，因为禀的前世曾经试图打破三界壁垒，结果导致了一场灾难，长老们怕他再犯，就把他的记忆抹了。禀在枫、亚沙和铃的帮助下找回了前世的记忆，他想起自己曾经爱过一个既不是神也不是魔的女孩，那个女孩在三界大战中死了，他答应过她要让神魔人不再互相仇恨。高潮是三界大会，神魔长老要处决禀以维持封印，希娅和奈莉奈同时站到禀前面，枫、亚沙和铃也带着人间代表闯进会场，禀用前世记忆里的魔法阵把三界壁垒打开了一道缝，光从缝里照进来，三界代表第一次看见彼此的脸，不是敌人，是长得差不多的普通人。禀最终没有选任何人，他留在了三界交界的魔法花园里，希娅种花，奈莉奈修飞艇，枫和亚沙在人间开了一间咖啡店，铃还是到处捣乱，只是每次路过花园都会往禀的窗户上扔一颗糖。主角名称包括土见禀、希娅、奈莉奈、菲亚、枫、亚沙、铃、神界国王、魔王，而《Shuffle! Memories》用神魔人三界、婚约争夺、记忆封印和前世今生串成一部又甜又虐的动漫，也让观众看到，当AI和算力让世界变得越来越透明时，真正让人心动的仍然是希娅在河边把昏迷的禀拖回家时，自己裙子湿了一半却笑得像捡到宝的样子。