很久以前，在人迹罕至的深山之中，建有一座人类最前沿的研究中心。某日，研究用的主控计算机突然觉醒自我意识并陷入暴走。人类费尽千辛万苦终于阻止了这场危机，取回了久违的和平……看起来似乎是这样的。 回到和平生活的人们，为了预防敌人再次暴走袭来，准备了巨大的萝卜型机甲，并选拔出战士们进行严苛训练。某日，这一天终于来临了。 在一个毫无任何征兆的日子里，地球上空突然出现一艘黑色的海盗船。船上乘坐的是宇宙帝国“残虐”的新任司令官巴卡斯·基鲁以及海贼战队豪快者的各位。令人难以置信的是，凭借顽强的斗志和无可匹敌的正义感，第35代豪快者本应拼尽全力守护地球、与野心勃勃的残虐作斗争，如今却调转枪头，成为了特命战队Go-Busters最强的对手。 为了争夺蕴藏着宇宙间最强大力量的联者钥匙，两队超级战士展开殊死搏杀。最终，五把钥匙集结完毕，但一股神秘力量却将战士们吞入一个未知的空间。 站在袭来的敌人们面前的队伍，就是特命战队Go-Busters！！超级战士们的下落如何？海贼战队豪快者与残虐联手的背后又隐藏着什么样的秘密？ 他们的战斗，现在开始！