杨康之子杨过（陈晓 饰）自幼流落江湖，于偶然之中被故人郭靖（郑国霖 饰）与黄蓉（杨明娜 饰）夫妇收留。然而，杨过虽具备极高的武学天赋，却生性顽劣，四处招惹是非并闯下大祸。郭靖夫妇无奈之下，只得将他送往全真教，希望师长能够严加调教。无法忍受全真教苛刻森严的教规与苦不堪言的日子，杨过决意逃跑，却在误打误撞之中闯入了禁地古墓。在那里，他邂逅了恍若天人的小龙女（陈妍希 饰）。就此，杨过拜小龙女为师，修习古墓派武功。随着时光推移，两人在朝夕相处中渐渐生出了超越师徒之上的刻骨铭心的爱恋。赤练仙子李莫愁（张馨予 饰）的闯入，使得杨过与小龙女被卷入了剪不断理还乱的江湖纷争。此时蒙古铁骑即将南下，郭靖等群雄难以匹敌，关键时刻，杨过与小龙女无意中卷入纷争，合力打败金轮国师。然而好事多磨，二人多次聚散，在经历了武林大会、襄阳鏖兵、绝情幽谷等重重险境后，更是迎来了漫长的十六年生离死别。痴情的杨过终于在绝情谷底找到了大难不死的小龙女，二人重返世间。此时蒙古正调集人马猛攻襄阳，杨过不仅击败了金轮法王，更以飞石击毙蒙古皇帝蒙哥，为襄阳保卫战立下首功。战事平息后，杨过与小龙女携手告别郭靖等人，带着神雕，悠然远去。